Elle est née le 7 février 1619 à Beaune.
Ses parents, Pierre Parigot et Jeanne Battaille, étaient des bourgeois influents et aisés qui ont su orienter très tôt l'enfant vers une vie authentiquement chrétienne. À l'âge de 12 ans, Marguerite perd ses deux parents. Son oncle, un prêtre qui avait fait don de l'ancien cloître aux Carmélites, décide de confier sa nièce aux soins des religieuses et de leur confier l'éducation de la jeune fille.
Ainsi, le 24 septembre, avec une permission spéciale des Supérieurs, elle entre au Carmel, recevant le même jour sa première communion des mains de son oncle. Selon la coutume de l'Ordre, un nouveau nom lui fut imposé, auquel, en souvenir de la grâce insigne accordée ce jour-là à l’heureuse enfant, fut ajouté le mystère : "du Saint-Sacrement".
Dès son noviciat, elle comprend avec une clarté étonnante que Dieu lui avait confié une mission particulière. Elle devait faire connaître au monde les trésors de sa divine Enfance et les souffrances douloureuses du Sauveur.
Au Carmel de Beaune, Marguerite trouve non seulement une profonde compréhension de sa dévotion et de son amour pour l'Enfant Jésus, mais aussi un sol fertile dans lequel le grain de blé peut prendre racine et s'épanouir.
Les premières années de sa vie religieuse, elle souffre indiciblement sous les assauts souvent durs et féroces de l'ennemi pervers. Parfois, il semblait que la pauvre enfant devait lutter contre "les principautés et les puissances, contre les dominateurs de ce monde de ténèbres, contre les esprits mauvais répandus dans l'air". Toutefois, tout cela ne faisait que purifier son amour, la poussant à se réfugier uniquement aux pieds de l'Enfant Jésus.
Chaque jour, matin et soir, Marguerite restait longuement en prière devant l'Enfant Jésus. Lorsqu'elle tomba gravement malade et sentit sa dernière heure approcher, elle demanda avec insistance qu'on lui accorde la joie de voir son cher Roi de Grâce déplacé à proximité de l'infirmerie, afin qu'elle puisse le contempler et faire son ultime sacrifice sous son regard.
Il meurt en 1648, à l'âge de 20 ans.
Le décret sur l'héroïcité des vertus a été promulgué le 10 décembre 1905.
